Rakouskí architekti zvítězili v soutěži na tento projekt již v roce 2001 a jeho realizace nebyla snadná: stavební proces byl na dva roky přerušen a jeho první fáze zahrnovala výhradně stavbu pilotového základu (celková délka ražených pilot byla 536 m). Byly nezbytné, protože muzeum bylo postaveno na slabé pobřežní půdě - na soutoku Rhone a Soni. Soutok se překládá jako „sloučení“; je to také název celé oblasti sousedící se „šipkou“(point de confluence, „point of confluence“).
Muzeum je důležitou budovou ve městském měřítku: jeho prominentní poloha z něj činí „maják“a symbol celé nové čtvrti Confluence - bývalého poloostrova průmyslové zóny poblíž centra Lyonu, který je nyní budován kulturními instituce, kancelářské a obytné budovy navržené předními architekty.
Budova Coop Himmelb (l) au se nachází na frekventovaných pěších trasách, proto, aby se nevytvořila překážka pohybu občanů, je budova vyvýšena nad zemí a pod ní je „náměstí“s restaurací.
Muzeum soutoku se skládá ze tří částí. Na „podstavci“, na kterém se nachází výše zmíněné „náměstí“, jsou umístěny dvě hlediště (pro 327 respektive 122 míst), prostory pro žáky z okolních škol, sklady a dílny, zasedací místnosti. Glazed Crystal je lobby se spirálovou rampou, schody a výtahy a knihkupectví. Třetím a nejdůležitějším dílem je nerezový „Cloud“s nosnou konstrukcí, jako je most. K dispozici je 9 sálů (4 pro stálé a 5 pro dočasné výstavy) a „veřejné“dílny; na horní úrovni jsou administrativní kanceláře a na střeše kavárna a solární panely. „Létající“konzolová ramena budovy jsou inspirována vodními proudy splývajícími vedle sebe.
Rozpočet projektu činil 185 milionů eur (3980 eur za metr čtvereční).