Architekti David Childs a Daniel Libeskind zdokonalují „koncept“mrakodrapu, který byl vytvořen společně v prosinci 2003, už rok a půl. Když byla aktualizovaná verze téměř hotová, vyšlo newyorské policejní oddělení s opožděným požadavkem, aby byla budova bezpečnější, a co nejvíce ji chránila před teroristickými útoky, zejména před výbuchem bomby v autě.
Výsledkem bylo, že věž byla vzdálena od vozovky o 12 metrů a její základna byla přeměněna na monolitický podstavec s výškou 20 pater (60 m). Celkově se stavba zvedne na 1365 stop (415 m), což se rovná výšce jedné z dvojitých věží, a společně se střešním parapetem bude její výška 1368 stop (417 m), což je stejná jako druhá struktura. Celková výška díky obrovské anténě dosáhne symbolických 541 metrů - v roce 1776 získaly USA nezávislost.
V procesu přepracování projektu energický vzestupně zkroucený tvar prvního vydání zmizel a věž umístěná na okraji střechy věže, odrážející zvednutou ruku Sochy svobody, se přesunula do stabilního středu. Plán se změnil z rovnoběžníku na náměstí o straně 60 m - jako ve starých mrakodrapech WTC. Lehká konstrukce v horní části věže kabelů a větrných turbín úplně zmizela.
Na kubický základ budovy, kde jsou k dispozici pouze malé okenní štěrbiny ve výšce 9 m, se vejde lobby a technické podlahy. Vnější část bloku bude oživena gravírovanými plechy.
K oživení prostoru kolem je povolán zahradní architekt Peter Walker, pro kterého se jedná o druhou objednávku v novém komplexu WTC: společně s Michaelem Aradem vytvořil také projekt památníku obětem teroristických útoků.
Nahoře se čtverec plánu plynule změní na osmiúhelník a poté znovu na čtverec. Nový projekt má obecně mnohem více společného se starým Světovým obchodním centrem a vzhledem k monolitickému podstavci mrakodrapu daleko předčí své předchůdce v závažnosti a nepřístupnosti. Odpověď na teroristy, kterou by měla budova ztělesňovat, se změnila z výzvy ve světě svobody na výzvu mocné říše.